Seoul is overgenomen door LEGION. Aan de Agents de taak om met de hulp van de ARK-basisagenten Seoul van LEGION’s onderdrukking te bevrijden. Agents ingenieur Gremlin runt het R&D-lab. Gremlin is manisch positief en dankzij haar ondeugende nieuwsgierigheid voor machines ontwerpt zij MAYHEM’s dodelijkste wapens. Bijvoorbeeld de Gutterball Gun, die door middel van gigantische elektrische ballen alles op zijn pad vernietigd, maar ook de Cabbit Bomb, die vijanden in explosieve konijntjes veranderd. De gestoorde wapens van Gremlin zijn te vinden op verborgen locaties verspreid door de stad. Hoewel haar spullen niet altijd even goed zijn getest op veiligheid, is een groot spektakel gegarandeerd!
Vecht tegen Dr. Babylon en versla zijn luitenanten, zodat de onderdrukking van LEGION zal verzwakken. Lokaliseer en elimineer de troepen van LEGION, verwoest hun voorraadtrucks, red gevangengenomen wetenschappers of neem een van LEGION’s schuilplaatsen over en gebruik de intel om andere activiteiten vast te stellen. Overigens laat Dr. Babylon Agents niet zomaar ongestoord binnendringen dus wees op je hoede voor zijn maatregelen. Bij iedere aanval volgt een directe reactie van Dr. Babylon: zijn buitenposten zijn versterkt met Sniper Nests, barricades, mijnen en Mole Machines met extra troepen. Heeft hij een slechte dag, dan kun je zomaar het pure kwaad aanschouwen van het krachtige Doomsday wapen!